Información general

Convocatoria de Participación en la Tarea LivingNER (IberLEF2022)
Reconocimiento automático de menciones, normalización y clasificación de especies, patógenos y alimentos en textos médicos en español
 
Información esencial:
- Web: https://lnkd.in/dvcUgRhy
- Datos: https://lnkd.in/d3_TCDzw
- Guías: https://lnkd.in/dDns_cMW
- Participación: https://lnkd.in/dTT2PMBe
- LivingNER léxico: https://lnkd.in/d2HSdkKN
- Traducción automática (proyectos multilingües): https://lnkd.in/d3_TCDzw
 
LivingNER es la primera tarea específicamente dedicada a la detección automática de menciones de especies (humanos, plantas, animales, insectos, patógenos) en casos clínicos, así como su mapeo a conceptos taxonómicos (NCBI Taxonomy).

La detección, normalización y clasificación de menciones de especies es relevante para aplicaciones en el ámbito de la medicina, biología, epidemiología, veterinaria o nutrición. Representa una componente clave para la minería de texto aplicada a:
- Patógenos, incluidas enfermedades infecciosas, tropicales transmisibles y vectores
- Lesiones, mordeduras, picaduras y arañazos causados por animales en humanos
- Mascotas y animales de granja (incl. zoonosis y veterinaria)
- Microorganismos, resistencia a antibióticos, microbioma
- Infecciones hospitalarias o nosocomiales
- Alergia alimentaria, intoxicación alimentaria, dietas, interacciones entre medicamentos y alimentos
- Epidemiología y antecedentes familiares (contactos cercanos, cohabitantes y parientes)
 
Se publicarán recursos multilingües para enfatizar el potencial de adaptación multilingüe de los sistemas participantes.

Tras el éxito de tareas anteriores (CANTEMIST, PharmaCoNER y MEDDOCAN), lanzamos la tarea LivingNER como parte de la iniciativa IberLEF 2022 (conferencia SEPLN 2022):

- LivingNER-Clinical NER: detección automática de menciones de especies (incl humanos).

- LivingNER-Species Norm: detección de menciones de especies y mapeo a conceptos de la NCBI Taxonomy.

- LivingNER-Clinical IMPACT: clasificación de documentos relacionados con:

a) mascotas/animales de granja,

b) animales que causan lesiones,

c) alimentos y

d) infecciones nosocomiales (asi como deteccion de la evidencia textual).

Calendario
- Test set (inicio evaluación): 22 de abril de 2022
- Fin evaluación: 22 de mayo de 2022
- Envío de artículos: 17 de junio de 2022
- Notificación de aceptación: 26 de junio de 2022
- IberLEF @ SEPLN 2022: Septiembre 2022
 
Publicaciones y IBERLEF/SEPLN2022
Se invitará a los participantes a contribuir un artículo que describa su sistema (Working Notes de IberLEF - SEPLN 2022) y a dar una charla en el taller de IberLEF2022.

Organizadores:
- Martin Krallinger, Barcelona Supercomputing Center, Spain
- Eulàlia Farré-Maduell, Barcelona Supercomputing Center, Spain
- Salvador Lima López, Barcelona Supercomputing Center, Spain
- Antonio Miranda-Escalada, Barcelona Supercomputing Center, Spain

Áreas temáticas: Lingüística computacional, lingúística de corpus, análisis léxico, terminología